MED22 - MED22 - Wikipedia

MED22
Идентификаторы
ПсевдонимыMED22, MED24, SURF5, surf-5, субъединица 22 медиаторного комплекса, SRB6
Внешние идентификаторыOMIM: 185641 MGI: 98446 ГомолоГен: 4913 Генные карты: MED22
Расположение гена (человек)
Хромосома 9 (человек)
Chr.Хромосома 9 (человек)[1]
Хромосома 9 (человек)
Геномное расположение MED22
Геномное расположение MED22
Группа9q34.2Начинать133,338,312 бп[1]
Конец133,348,131 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE SURF5 206593 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_181491
NM_006752
NM_133640

NM_001033908
NM_011513
NM_001378786
NM_001378787
NM_001378788

RefSeq (белок)

NP_598395
NP_852468

NP_001029080
NP_035643
NP_001365715
NP_001365716
NP_001365717

Расположение (UCSC)Chr 9: 133,34 - 133,35 МбChr 2: 26.91 - 26.91 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Медиатор субъединицы транскрипции РНК-полимеразы II 22 является фермент что у людей кодируется MED22 ген.[5][6][7]

Функция

Этот ген находится в пресыщение кластер генов, группа очень тесно связанных домашних генов, которые не имеют сходства последовательностей. Ген ориентирован «голова к голове» с RPL7A (SURF3), и два гена имеют общий двунаправленный промотор. Кодируемые белки локализуются в цитоплазме. Для этого гена идентифицированы два альтернативных варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы.[7]

Взаимодействия

MED22 был показан взаимодействовать с MED30.[8]

Модельные организмы

Модельные организмы были использованы при изучении функции MED22. Условный нокаутирующая мышь линия называется Med22tm1a (EUCOMM) Wtsi был создан на Wellcome Trust Sanger Institute.[9] Самцы и самки животных прошли стандартизованный фенотипический скрининг[10] для определения последствий удаления.[11][12][13][14] Проведены дополнительные проверки: - Углубленное иммунологическое фенотипирование[15]

Рекомендации

  1. ^ а б c ENSG00000148297 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000281022, ENSG00000148297 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000015776 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Йон Дж., Джонс Т., Гарсон К., Шир Д., Фрид М. (март 1993 г.). «Организация и сохранение человеческого кластера генов Surfeit и его теломерная локализация в c-abl и can протоонкогены в полосе хромосомы 9q34.1». Молекулярная генетика человека. 2 (3): 237–40. Дои:10.1093 / hmg / 2.3.237. PMID  8499913.
  6. ^ Сато С., Томомори-Сато К., Пармели Т.Дж., Флоренс Л., Зыбаилов Б., Суонсон С.К., Бэнкс, Калифорния, Джин Дж., Цай И., Уошберн М.П., ​​Конавей Д.В., Конавей Р.К. (июнь 2004 г.). «Набор консенсусных медиаторных субъединиц млекопитающих, идентифицированных с помощью технологии многомерной идентификации белков». Молекулярная клетка. 14 (5): 685–91. Дои:10.1016 / j.molcel.2004.05.006. PMID  15175163.
  7. ^ а б "Entrez Gene: SURF5 избыток 5".
  8. ^ Сато С., Томомори-Сато С., Бэнкс Калифорния, Сорокина И., Пармели Т.Дж., Конг С.Е., Джин Дж., Цай Й., Лейн В.С., Брауэр С.С., Конавей Р.К., Конавей Дж.В. (апрель 2003 г.). «Идентификация медиаторных субъединиц млекопитающих с подобием дрожжевых медиаторных субъединиц Srb5, Srb6, Med11 и Rox3». Журнал биологической химии. 278 (17): 15123–7. Дои:10.1074 / jbc.C300054200. PMID  12584197.
  9. ^ Гердин А.К. (2010). «Программа генетики мыши Сэнгера: характеристика мышей с высокой пропускной способностью». Acta Ophthalmologica. 88. Дои:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x. S2CID  85911512.
  10. ^ а б «Международный консорциум по фенотипированию мышей».
  11. ^ Скарнес В.С., Розен Б., Вест А.П., Кутсуракис М., Бушелл В., Айер В., Мухика А.О., Томас М., Харроу Дж., Кокс Т., Джексон Д., Северин Дж., Биггс П., Фу Дж., Нефедов М., де Йонг П.Дж., Стюарт AF, Брэдли А. (июнь 2011 г.). «Ресурс условного нокаута для полногеномного исследования функции генов мыши». Природа. 474 (7351): 337–42. Дои:10.1038 / природа10163. ЧВК  3572410. PMID  21677750.
  12. ^ Долгин Э (июнь 2011 г.). "Библиотека мыши настроена на нокаут". Природа. 474 (7351): 262–3. Дои:10.1038 / 474262a. PMID  21677718.
  13. ^ Коллинз Ф.С., Россант Дж., Вурст В. (январь 2007 г.). «Мышь по всем причинам». Клетка. 128 (1): 9–13. Дои:10.1016 / j.cell.2006.12.018. PMID  17218247. S2CID  18872015.
  14. ^ Уайт Дж. К., Гердин А. К., Карп Н. А., Райдер Э., Бульян М., Басселл Дж. Н., Солсбери Дж., Клэр С., Ингем Нью-Джерси, Подрини С., Хоутон Р., Эстабель Дж., Боттомли Дж. Р., Мелвин Д. Дж., Сантер Д., Адамс Н. , Logan DW, Macarthur DG, Flint J, Mahajan VB, Tsang SH, Smyth I, Watt FM, Skarnes WC, Dougan G, Adams DJ, Ramirez-Solis R, Bradley A, Steel KP (июль 2013 г.). «Полногеномное поколение и систематическое фенотипирование мышей с нокаутом открывает новые роли для многих генов». Клетка. 154 (2): 452–64. Дои:10.1016 / j.cell.2013.06.022. ЧВК  3717207. PMID  23870131.
  15. ^ а б «Консорциум иммунофенотипирования инфекций и иммунитета (3i)».

дальнейшее чтение