Корархеота - Korarchaeota

Корархеота
Korarchaeota.jpg
Сканирующая электронная микрофотография Обсидиановый бассейн обогащение культуры, показывая корархеоты.
Научная классификация
Домен:
Археи
Королевство:
"Протеоархеи "
Суперфилум:
TACK
Тип:
Корархеота

Barns et al. 1996 г.
Виды
Синонимы
  • Korarchaeota Barns et al. 1996 г.
  • Xenarchaea
  • Xenarchaeota

В таксономия, то Корархеота площадь филюм из Археи.[1] Название происходит от греческого существительного корос или коре, что означает молодой человек или молодая женщина, и греческое прилагательное archaios, что означает древний.[2] Они также известны как Xenarchaeota.

Таксономия

Корархеота считается филюм, который сам по себе является частью архейного суперфильма TACK, который включает Таумархеота, Aigarchaeota, Crenarchaeota и Корархеота.[3]

Филогения

Анализ их последовательностей гена 16S рРНК позволяет предположить, что они представляют собой глубоко разветвленную линию, не принадлежащую к основным группам архей, Crenarchaeota и Euryarchaeota.[4] Анализ генома одной корархеоты, который был обогащен из смешанной культуры, выявил ряд особенностей, как Crenarchaeota, так и Euryarchaeota, и поддерживает гипотезу о глубоком ветвлении предков.[5]

Контрольные виды

Напряжение Корархеум криптофилум был выращен в культуре обогащения из горячего источника в Йеллоустонском национальном парке в США в 2008 году.[5] Клетки длинные и игольчатые, что дало этому виду название, отсылающее к его «криптическим нитям».

Экология

В Корархеота были обнаружены только в гидротермальных средах. Похоже, что они диверсифицировались на разных филогенетических уровнях в зависимости от температуры, солености (пресная или морская вода) и / или географии.[6] Корархеи встречаются в природе в небольшом количестве.[6][7][8]

В каждом из этих шести горячих источников (сверху слева по часовой стрелке: Узон4, Узон7, Узон8, Узон9, Мут11, Мут13) на Камчатке были обнаружены корархеи.
В каждом из этих шести горячих источников (по часовой стрелке сверху слева: Узон4, Узон7, Узон8, Узон9, Мут11, Мут13) на Камчатке обнаружены корархеи.[6]

использованная литература

  1. ^ Увидеть NCBI сайт о Корархеоте. Данные извлечены из "Ресурсы таксономии NCBI". Национальный центр биотехнологической информации. Получено 2007-03-19.
  2. ^ Элкинс, JG; Подар, М; Graham, DE; и другие. (Июнь 2008 г.). «Геном корархей раскрывает понимание эволюции архей». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 105 (23): 8102–7. Bibcode:2008PNAS..105.8102E. Дои:10.1073 / pnas.0801980105. ЧВК  2430366. PMID  18535141.
  3. ^ Гай Л., Эттема Т.Дж. (2011). «Суперфилум архей TACK и происхождение эукариот». Тенденции Microbiol. 19 (12): 580–7. Дои:10.1016 / j.tim.2011.09.002. PMID  22018741.
  4. ^ Barns SM, Delwiche CF, Палмер JD, Pace NR (август 1996 г.). «Перспективы разнообразия архей, термофилии и монофилии на основе экологических последовательностей рРНК». Proc. Natl. Акад. Sci. Соединенные Штаты Америки. 93 (17): 9188–93. Bibcode:1996PNAS ... 93.9188B. Дои:10.1073 / пнас.93.17.9188. ЧВК  38617. PMID  8799176.
  5. ^ а б Элкинс Дж. Г., Подар М., Грэм Д. Э., Макарова К. С., Вольф Ю., Рандау Л., Хедлунд Б. П., Брошье-Арманет С., Кунин В., Андерсон И., Лапидус А., Гольцман Е., Барри К., Кунин Е. В., Гугенгольц П., Кирпидес Н., Ваннер Г., Ричардсон П., Келлер М., Стеттер К.О. (июль 2008 г.). «Геном корархей раскрывает понимание эволюции архей». Proc. Natl. Акад. Sci. Соединенные Штаты Америки. 105 (1): 8805–6. Bibcode:2008PNAS..105.8102E. Дои:10.1073 / pnas.0801980105. ЧВК  2430366. PMID  18535141.
  6. ^ а б c Аухтунг Т.А., Шиндряева Г., Кавано К.М. (2011). «Филогенетический анализ 16S рРНК и количественное определение корархеот, обитающих в горячих источниках Камчатки, Россия». Экстремофилов. 15 (1): 105–116. Дои:10.1007 / s00792-010-0340-5. PMID  21153671.
  7. ^ Рейгстад ​​Л.Дж., Йоргенсен С.Л., Шлепер С. (2010). «Разнообразие и изобилие корархеот в наземных горячих источниках Исландии и Камчатской Ямайки». ISME J. 4 (3): 346–56. Дои:10.1038 / ismej.2009.126. PMID  19956276.
  8. ^ Auchtung Thomas A. (2007) Экология гидротермального кандидатского археологического подразделения, Корархеота. Кандидатская диссертация, Гарвардский университет.

дальнейшее чтение

Научные журналы

Научные книги

Научные базы данных

внешние ссылки